1、可升级的电子转移裂解（ETD)模块可以提供传统裂解方法无法得到的蛋白质翻译后修饰信息；
2、脉冲碰撞能量诱导解离（PQD)功能可以提供低质量端碎片离子信息；
3、高选择MS/MS分析给谱图在数据库和谱库检索更好的匹配，提高了结构确证的可靠性。另外快速极性切换，母离子相关MS3数据关联扫描，可以对翻译后修饰和代谢物组成的鉴定进行智能、快速分析，还可以和高端的回旋共振质谱组合成多级高分辨杂交质谱仪；
4、自动数据依赖性多级质谱采集技术不仅为用户提供预测代谢物（母离子列表）结构信息，也能提供未预测到的代谢物结构信息。此外使用自动固定中性丢失数据依赖性(CNL)扫描触发3级质谱扫描能检测某一类的代谢物。使用MetworksTM 和Mass Frontier分析软件增强复杂基质中代谢物筛选和鉴别功能，使谱图解析更简便。
赛默飞线性离子阱质谱仪LTQ XL离子化技术：
* IonMax离子源：ESI(电喷雾电离），APCI(大气压化学电离）和APPI（大气压光电离）探头都是基于革新的Ion Max离子源而设计。它具有超高性能，结构简单以及无需工具就可进行ESI和APCI探头更换的特点，探头在x，y，z三个方向均可调节。无论对于低流速还是高流速，都可以优化zui佳位置获得不错的灵敏度。
* 满足各种需要的离子源配置：ESI(电喷雾电离源），APCI(大气压化学电离源），APPI（大气压光电离源），纳喷电离源（NSI)。
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